Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms