Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb5Q02739 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb5Q02739 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms