Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RykQ01887 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms