Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms