Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms