Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pde1bQ01065 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms