Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms