Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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