Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcgP82348 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcgP82348 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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