Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TgfbiP82198 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms