Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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