Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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