Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms