Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NficP70255 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NficP70255 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms