Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgb1P63158 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgb1P63158 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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