Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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