Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms