Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CirbpP60824 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CirbpP60824 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms