Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CgnP59242 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CgnP59242 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms