Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms