Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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CtdsplP58465 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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CtdsplP58465 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CtdsplP58465 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtdsplP58465 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms