Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpa1P57784 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms