Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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NcstnP57716 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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