Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc10P56960 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc10P56960 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms