Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PctpP53808 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms