Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpaP53566 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms