Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FmodP50608 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms