Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmod1P49813 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod1P49813 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms