Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt1P46096 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms