Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms