Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HmgclP38060 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgclP38060 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgclP38060 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgclP38060 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HmgclP38060 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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