Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms