Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TpoP35419 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms