Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms