Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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PtprmP28828 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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