Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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