Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NapbP28663 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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NapbP28663 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NapbP28663 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NapbP28663 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NapbP28663 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NapbP28663 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms