Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sept4P28661 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sept4P28661 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sept4P28661 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sept4P28661 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms