Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Defa5P28312 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms