Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RdxP26043 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RdxP26043 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms