Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms