Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Xrcc6P23475 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc6P23475 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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