Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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