Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms