Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms