Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RaraP11416 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RaraP11416 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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