Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms