Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P10404 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P10404 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms