Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa5P09021 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxa5P09021 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms