Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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